Aug 30 2007

我的课程表

分类: studyazalea @ 4:49 am 209次阅读

http://www.google.com/calendar/embed?src=ujestgqj2qqnci46ij1vhnnnq8%40group.calendar.google.com&mode=AGENDA由于是美国东部时间,大家把AM和PM换一下看好了

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Aug 30 2007

和Claude dePamphilis等一堆人的谈话

分类: studyazalea @ 3:01 am 285次阅读

下午去找Istvan Albert谈我rotation的project, 他问我的background, 讲到我以前lab做的事,他说不要告诉我别人做什么,告诉我你做了什么。我就汗。。想了半天哪些是我做的,最后他总结到,你会用perl写处理text的程序,我说是,他于是给了我一些数据让我用python统计并plot,又借我一本python cookbook,让我有问题来问,说明天带笔记本来实验室就好了。正自惭形秽准备离开,看到Gue Su Chang,那天pizza dinner聊过的师兄,又遇到一个印度师兄,venky, 振海,大家围坐一团,讨论各个professor,像讨论mn似的-,-他们说PSU最牛的2个bioinfo的人:Webb Miller & Ross Hardison, 又说到做植物基因组最牛的三个prof,只记得Sarah Assmann和Claude dePamphilis. Claude dePamphilis非常nice, 今年很可能招人。2位师兄说很多导师都需要bioinformatist,但是很奇怪我们program今年只有4个新生,还包括我这么菜的-,- 不过明年要组建Systems Biology专业,估计会有更多新生来:)

下面说重点。谈话完毕,振海Venky和我杀向Claude的lab,Claude本人和照片一样可爱,胡子很长,以至于我后来N次走神都因为看他黑白灰相间的胡子-,-Claude先让我们轮流介绍background,不时发出no kidding!的感叹。ps.他竟然知道复旦大学,还知道我们遗传学很强 orz 然后又讨论我们想做什么。everybody says gene regulation network。然后Claude讲他们lab的工作,说到这个话题时他巨兴奋,very excited!主要有3个,一个是Populus microRNA prediction,一个是开花植物的EST database和祖先基因,还有一个是parasite plant的EST,后面2个是很大的project,主要的funding来源。然后我们讨论了啥是parasite plant,就是寄生在其他植物上的植物,有些是semi-parasite,就叶绿体,有些没有叶绿体,完全依靠宿主的nutrients。有些prasite plant寄生于农作物上,影响了农业。他们的研究以corn&寄生于corn的植物和rice&寄生于rice的植物为
对象,希望通过全基因组EST测序,发现寄生植物中控制寄生的基因,然后改变宿主的基因,使之产生以这些寄生基因为靶标的microRNA,降解寄生植物中的关键基因,他们就挂了。。我问parasite plant和host的关系一定是对host有害的么?Claude画了个图给我们,最常见的是parasite(+)/host(-),这种情况尤其发生在parasite新近发现的宿主身上。也有parasite(+)/host(0)即宿主无害无利。但是parasite和host双赢的情况很少,一个例子是一种真菌寄生于植物,吸收植物的养分,同时帮助植物吸收水和矿物。于是胡乱建议到可否改变作物或寄生植物的基因,使之关系变成(+)/(+),not to inhibit, but to encourage.Claude想了下,说that is possible。很有兴趣的样子,hiahia。然后他又讲到一个evidence,寄生植物的基因组,在寄生之后,关于光合作用的基因剧烈减少,但同时核基因组(不知道是不是听错了)却增大了,he doesn’t know why. 又讲到parasite gene(忘记确切是不是这个), 就是说一些tranportable elements在别的基因组中复制,消耗能源,但却对宿主没什么好处。在parasite plant体内发现有许多transposon,而他们的宿主体内也有4个这样的transposon,于是推测,很可能parasite plant和宿主之间有基因交流。这就是parasite gene inside parasite plant。A寄生于B寄生于A,真是神奇!

总结一下,今天听了这席话很开心,觉得PSU真是好,学校大教授多,即使每天和教授聊聊天,也能听到不少exciting的东东。而且Claude很nice,不像和Pugh以及Reka讲话那样恐怖-,- 算是满足了一下我的期望~之前想来米国就是为了能经常和牛人聊天,现在觉得也差不多了:)

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Aug 29 2007

悲凉的joke(转载)

分类: everyday, funazalea @ 5:30 am 218次阅读

 一日,胡主席来到基层 慰问并发表演说。台上,胡主席对台下的劳苦大众说:“同志们,一个月后,预计我国的猪肉价格要上涨50%!”话音刚落,台下一个工人大叔高声喊道:“没关 系。主席,那样的话我们会更加努力的工作!”胡主席接着说:“同志们,两个月后,我国蔬菜价格也要上涨很大的幅度!”那个大叔又喊道:“主席,放心,我们 会加班工作!”胡主席又说:“亲爱的同志们,你们让我很感动,但我不得不告诉你们,三个月后,我国粮食价格要翻一番!”又是那个大叔喊道:“主席,如果真 是那样的话我们只能不分昼夜的工作了。”此时此刻胡主席感动得热泪盈眶,他走下台去,拉住那位大叔的手说:“同志!您真是party的好同志!请问您在哪 里工作?” “主席,火葬厂。”

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Aug 27 2007

写一个朋友

分类: everydayazalea @ 10:45 am 336次阅读

我第一天在PSU的校园,看地图时,一个美国lady费力的从手包中拿出眼镜,想帮我指路,他突然过来说,I think I can help her。那个lady似乎有点郁郁地走了,然后他带我去了图书馆,在里面聊了很久,关于学校的一切,知道了学校由4条路包围,知道了Copper Beach,知道他也是新生,不过5月就从Florida过来了。。留了他的联系方式,然后到图书馆外等刘叔叔的车,他帮我打电话给UA问行李啥时候到,惊叹于他口语的流利。一个多星期后,在Thomas楼前偶遇,一向不记得人的我竟然认出了他,他说早就看到了我的自行车(上次谈到过),又说自己刚捡了一辆。。然后去注册口语考试,下午一起考完,又报名去华盛顿。之前我本来没想去,不过想去认识下朋友也好。颇费周折的报名,我先存钱到他lioncash上,现金还是不够,又帮他刷了10块钱。。约好下午一起骑车去Mt Nittany,结果他迟迟不来,就和煎饼去Giant shopping,回来的路上遇到他离开。。于是一起去参观了他家,捡了床,买了浴帘。。又帮我搞定了必须开电扇才能开的灯,转天又帮我捡了掉在露台下的钥匙。。真是觉得,什么事遇到他都能迎刃而解。

然后18号早上,他开车接我和室友到学校,上了去华盛顿的车,他一直想坐第一排,在我的要求下坐到了第二排,其间一直号召别人陪他坐第一排,没人响应。。后来很庆幸和他坐在了一起。回来的路上,本来我们都打算睡觉,我说起5年内怎么也会打一次猎,于是他开始感慨,说了很多有道理的话,觉得没有许多经历的人是不会说的。而且很有思想,比我有逻辑多了。而且很善良。。

19号他带我到处去修车,不停安慰我,很理解我的心情,超级感动。。又陪我雨中打球。。然后又帮我换后飞到12点多,我自己绝不会这么认真对待我的车的。之后觉得关系近了很多,平时互相鄙视,虽然本来并没有鄙视的意思-,-

新的一周我们系orientation,他虽然读生物,却不属于Huck,我每次都叫他来蹭饭,以至于我一拿电话,别人就说:又叫他来蹭饭了?终于,周三下午picnic时,大家围成一圈自我介绍,他介绍时说:我是BMMB的,我不是Huck的,我今天来这里meet friends。众人笑。他说:but I swear to God, I didn’t eat a bit of food! 大家都说,吃吧吃吧,没关系的。之后大家见到他的表情,就仿佛他脸上写着几个字:我是蹭饭的!虽然我每次把这件事作为笑谈,但其实很欣赏他这一点。

然后就是周五,晚上我们打牌吃东西,大家走后我很失落,想起以前的朋友,伤感,一直没睡。他也一直在,和朋友电话到4点,我说我很伤感,但是MSN很卡!然后电话里谈起很多事,说到,朋友是多么重要。确实,他为朋友就是付出不求回报,其实也真的无以为报。

以前,我一直为没有一位蓝颜知己而遗憾,其实除了老公和Berit,我几乎不和别人谈心事,直到那天,我觉得自己终于有了可以倾心交谈的朋友,可以把烂事扔过去帮我搞定的朋友,可以在我最需要的时候给我信心的朋友。

随便看看



Aug 27 2007

来PSU3周大事记

分类: everydayazalea @ 9:17 am 254次阅读

从8月7号晚11点到达State College机场,到现在已经21天2小时了。发生了很多事,认识了很多人,很多感动。
6号一天,就有3个人说要去机场接我,1个是我爸朋友的朋友刘叔叔,2个是中国学生。7号晚,刘叔叔接了我,我就暂住他家。
8号刘叔叔送我到学校图书馆门口,我一路问人问到Life Sciences Building,Mike亲自带我去办ID card和computer account,炎炎中午走了很久。下午和刘叔叔一起找房子,找遍学校周围的apartment竟然都fully rented,恐怖!
之后的几天自己出去骑车,自己找房子,终于在13号确定了房子。当时竟然是6选1,感谢房东把房子租给了我。室友煎饼12号到,在motel住了2晚,在刘叔叔家一起吃了烤猪排,美味啊!
14号早上registration,许多志愿者,填了许多表,看到了Lisa和我另一个室友艳洁:) 14号晚上move in,没有床,不会用洗衣机,于是手洗了帐篷,睡了一晚-,-
照片在这里
15号考了口语考试,下午和李宁去买Washington DC trip的票,晚上捡到了床!2个部分分别捡自Copper Beach和Cherry Ln,感谢扔床的xdjm!室友煎饼借了床单给我。
然后的两天都不记得,18号一早去了Washington DC,虽然很累,很多地方没来得及去,不过大家一起玩很开心。回来的路上和李宁聊了一路,听了很多很有道理的话,而今只记得:不要想着以后有钱或者有威望了再帮助别人,这样永远不会有那么一天。从现在开始。
18号夜里回来,发现煎饼把我车的后飞骑断了,orz。。超级猛男。。转天上午李宁陪我跑遍State College买后飞都没买到,最后在Amazon上买了。。伤心。。于是下雨冒雨打了1小时网球。。
周一忘记做什么了。。
周二开始为期3天的Huck Institutes orientation,其实就是系里的新生入学教育。每天很忙碌,早9晚不止5,吃了很多免费午餐晚餐,认识很多新生老生和教授,非常开心!
周二晚和李宁修车到12点,终于修的可以变3速了。。感动ing
周四晚上结束了orientation,开始愁lab rotation,与2个prof预约面谈时间,又去downtown bicycle shop修了下车,可以变5速了-,-
周五一早收到大牛Frank Pugh的email,让我下午3点去见他,怕怕的看了一上午他的paper,匆匆过去又迟到了一分钟。谈了1个多小时,先是讨论我的experience,又介绍他的工作,我不时问些很傻的问题。他本来想让我第二或第三个rotation过来,我强烈要求下,Pugh终于说,I think I can find a way to accomodate you.谢天谢地,第一个rotation总算有地方去了!
很开心的回来,晚上叫来沈伟英和李宁打牌到2点,开始伤感起来,结果打电话说了很多心事,然后一早去Mt Nittany Hiking -,- 竟然看到了树懒!一路困得要死,几次差点迷路,走到很崩溃的时候,就说笑起死在nittany的话。Nittany山上都是碎石或小土路,路牌竟然就是树皮上一块白点。我们一直沿着白点走,绕来绕去,快绝望的时候说,如果沿着白点走,能走到起点,那真是奇迹!结果最后奇迹发生了!走到入口看到nittany的导游图,才知道白点本来就是一个环线!于是后悔之前没拿地图,不过当时的心境确实值得回味!
周六白天去了mall WalMart 晚上回来看书睡觉
今天10点多才起,本来想去买羽毛球拍,看到dicks $9.99可以买2个拍,吓得没有买,去打了会网球,继续被bs。。
下午去了CFA barbecue 于是回到了上篇文章。
晚上和LG等人聊天,发现到现在该看的paper还没看,明天下午还要和Reka讨论-,-
流水完毕,谢谢大家!谢谢耐心看到这里的朋友!kiss & hug!

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